G.I. Joe es un grupo de operaciones con capacidades especializadas, cuyo número de código es Sigma 6, y lucha contra una organización criminal que trafica armas ilegalmente denominada Cobra. El objetivo de Cobra es tomar el control del mundo para lograr su destrucción total. Los Sigma 6 utilizan armas sofisticadas diseñadas exclusivamente para cada una de sus misiones, combaten contra Cobra y proporcionan una solución rápida a pesar de las situaciones críticas que los rodean.